纳税人购进用于生产或委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。注意上述允许抵扣的进项都不是票据上的税额，而是根据下列公式计算出来的数据：进项税额＝买价×扣除率。
①农业生产者销售的自产农产品免征。对农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品，视同农业生产者销售自产农业产品免征。
②从事蔬菜批发、零售的纳税人销售的蔬菜免征。对从事农产品批发、零售的纳税人销售的部分鲜活肉蛋产品免征。
③自2019年1月1日至2021年12月31日，对农产品批发市场、农贸市场(包括自有和承租，下同)专门用于经营农产品的房产，暂免征收房产税和城镇土地使用税。对同时经营其他产品的农产品批发市场和农贸市场使用的房产，按其他产品与农产品交易场地面积的比例确定征免房产税和城镇土地使用税。
④国家指定的收购部门与村民委员会、农民个人书立的农副产品收购合同，免纳印花税。
在进项税额抵扣方面也有计算扣除的规定：
①从小规模纳税人处取得专用的，以专用上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额；
②取得（开具）农产品销售或收购的，以农产品收购或销售上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额；
法律依据：
《财政部国家税务总局关于免征蔬菜流通环节有关问题的通知》第二条规定
对从事农产品批发、零售的纳税人销售的部分鲜活肉蛋产品免征。免征的鲜活肉产品，是指猪、牛、羊、鸡、鸭、鹅及其整块或者分割的鲜肉、冷藏或者冷冻肉，内脏、头、尾、骨、蹄、翅、爪等组织。免征的鲜活蛋产品，是指鸡蛋、鸭蛋、鹅蛋，包括鲜蛋，冷藏蛋以及对其进行破壳分离的蛋液、蛋黄和蛋壳。